This is a practice test to help you prepare for the class test which will contribute 25% to your final grade. This practice test does not count towards your final grade but has the same instructions as the actual class test so you know what to expect (and therefore certain information, like the “you have two and a half hours to complete” instruction, does not apply to the practice test).

Introduction

This practice class test consists of three tasks worth a total of 40 MARKS broken down as follows: Task 1. A report on a statistical analysis of a given data set: 25 MARKS;

Task 2. A Further Task:  13 MARKS;

Task 3. Successful upload of appropriate  .pdf and  .Rmd files: 2 MARKS.

Tasks 1. and 2. are to be completed within the same R Markdown (.Rmd) file which produces one .pdf file. Task 1, the written report on a statistical analysis, should include:

●  An appropriate Title, the author’s student number and Introduction detailing the data set and question of interest 4 MARKS;

●  An Exploratory Analysis of the data 7 MARKS;

●  A Formal Analysis of the data 10 MARKS and

●  Conclusions 2 MARKS.

2 ADDITIONAL MARKS will be awarded for an appropriate report layout and clear English.

Instructions

1.  Go to the Practice Class Test Files folder in the Week 4:  Practice Class Test section of the Data Analysis Skills Moodle page.

2.  Download the files in the Practice Class Test Files folder to the same folder:

●  The data files containing the required data sets;

● PracticeClassTestTemplate.Rmd - a R Markdown template for the practice class test submission document. It includes the R packages necessary to complete the tasks.

3.  Open RStudio

4.  From within RStudio open Practice  ClassTestTemplate.Rmd then save it as                          YourStudentNumber_PracticeClassTest.Rmd in the same folder as the data files are saved.

5.  Before you start to work, compile YourStudentNumber_PracticeClassTest.Rmd (using Knit) and check that the YourStudentNumber_PracticeClassTest.pdf file is produced as you expected.  It is strongly recommended to periodically compile and check the .pdf file as you create your document so you can fix any bugs in your code as you go.

6.  For the report part of the class test (Task 1) you are NOT required to include your R code in the .pdf file, hence echo=FALSE is set as the default in the  .Rmd template.

However, for Task  2:  Further Task you need to provide your R code in the  .pdf file, and hence should include echo=TRUE in any R code chunks relating to the Further Task.

7. When  you  are  ready  to  submit  your  document,  click  on  the  Practice  Class  Test  .pdf  Up- load  link  in  the  Week   4:     Practice   Class   Test  section  and  upload  and  submit  the  file YourStudentNumber_PracticeClassTest.pdf.

8.  Also upload and submit the R Markdown file YourStudentNumber_PracticeClassTest.Rmd using the Practice Class Test .Rmd Upload link.  Please note that only the  .pdf file will be marked.  The .Rmd file will only be considered if there was a problem when compiling the  .pdf file.

Examination Conditions

● You have two and a half hours to complete the class test and you can submit your  .pdf and .Rmd files anytime within that time.

● You are required to use tidyverse functions (including ggplot2) for the analysis and RMarkdown to produce your document.

● You may consult resources (hard copy or online), e.g. tidyverse “cheat sheets” and/or the online labs from the course.

● You must  not communicate or correspond with anyone about the class test during the time that submissions are open. You must not submit material you have discussed with or copied from others. If your work is similar to those of any other candidate(s) you will both/all be suspected of collusion and referred to Student Conduct.

●  The work you submit must be entirely your own effort and must demonstrate your understanding rather than reproduce text from notes, slides, books, or online sources (which is plagiarism). We may conduct a further oral examination to check your knowledge and establish that the submitted files are your own work.

Task 1.  Anatomical Data from Domestic Cats

Digitalis is a heart medicine similar to toxins found in a genus of plants commonly known as foxglove. These

plants can be poisonous towards humans and pets. As part of digitalis experiments, 144 domestic male and female adult cats had their heart weight in grams (Hwt) and body weight in kilograms (Bwt) measured. The data are stored in cats.csv.

Using a linear model, describe the heart weights of male and female adult cats.  What does the model say about the difference, on average, between male and female cats? 25 MARKS

NB: For the purposes of Task 1, you are NOT required to include diagnostic plots (i.e. checks of the  residuals)  in  your  report  IF  they  support  the  assumptions  of the  fitted  model  but the code to produce these must still appear in the .Rmd file (but NOT the .pdf file).  IF the diagnostic plots show clear evidence that not all the assumptions are supported these diagnostic plots MUST be included in the report  (.pdf) to justify subsequent analyses  (e.g. the use of

transformations of the data to harmonize the assumptions of a linear model - see Lecture 10 of the Semester 1 Regression Models course)